进出口货物进口报关/清关代理程序是指为了确保进出口货物合法进出境，海关根据国家有关法律法规的不同要求，对进出门货物的进口报关/清关代理规定了一系列特定的手续和步骤，要求进口报关/清关代理人在进口报关/清关代理活动中必须遵循。在进口报关/清关代理活动中遵守规定的程序是进口报关/清关代理人的法定义务，否则将承担相应的法律责任。
根据时间的先后顺序和海关管理要求的不同，进出境货物的进口报关/清关代理一般可分为前期进口报关/清关代理程序、进出境进口报关/清关代理程序和后续进口报关/清关代理程序三部分。
前期进口报关/清关代理程序一般要在进出口货物在实际进出境之前向海关办理，其主要内容是进出口货物收发货人或其代理人向海关说明有关进出口货物的情况，申请适用特定的进口报关/清关代理程序。这一环节根据通关制度的不同，主要有加工贸易备案申请、特定减免税进口货物的减免税申请、暂准(时)进口货物的备案、扣保申请等海关手续;
进出境进口报关/清关代理程序是指进出门货物在进出境环节需向现场海关履行的手续，这一环节主要包括申报、陪同查验、缴纳税费、提取或装运货物等海关手续，需要在货物实质进出境时向海关办理，进出境进口报关/清关代理程序是任何通关制度下的进出口货物都必须履行经过的通关环节，只是由于进出口货物自身的情况导致不同通关制度下适用的具体情况会有所不同;
后续进口报关/清关代理程序则主要指进出口货物实际进出境以后，进出口货物收发货人或其代理人根据海关管理的要求向海关办理的旨在证明有关进出口货物合法进出口、在境内合规使用并已经完结有关海关监管义务的手续。这一环节主要有加工贸易核销、暂准(时)进出口货物担保的销案和特定减免税进口货物解除海关监管等海关手续。
在进口报关/清关代理过程中，不同通关制度项下的货物在进口报关/清关代理程序的适用上会有所不同，一般进出口货物只需通过进出境进口报关/清关代理程序即可完成全部进口报关/清关代理活动，但对于保税、特定减免税、暂准(时)进出口等货物，除了进出境程序外，在货物实际进出境前，一般需要经过前期进口报关/清关代理程序，办理相关的备案、申请手续;在货物实际进出境后，需经过后续进口报关/清关代理程序，办理相应的核销、销案及解除海关监管手续后才能完成全部进口报关/清关代理活动。
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